El mandat del Comitè Executiu, la Presidència i la Vicepresidència és de quatre anys i s'hauran de renovar, necessàriament, abans de sis mesos a partir de la constitució dels Ajuntaments i la formació del nou mandat de l'AMTU, els òrgans de l'associació únicament podran realitzar els actes propis de la gestió ordinària de l'associació.

Segons els Estatuts de l'Associació, l'AMTU s'estructura en els òrgans següents: